Package index

Cliente FHIR

Conectarse a un servidor FHIR R4 y hacer peticiones, como en Postman.

fhir_conectar()

Conectarse a un servidor FHIR

fhir_buscar()

Buscar recursos con paginación automática

fhir_leer()

Leer un recurso

fhir_everything()

Todos los datos de un paciente u otro compartimento ($everything)

fhir_exportar() fhir_exportar_estado() fhir_exportar_cancelar()

Exportación masiva de datos (FHIR Bulk Data, $export)

fhir_crear() fhir_actualizar() fhir_borrar()

Crear, actualizar y borrar recursos

fhir_validar()

Validar un recurso en el servidor ($validate)

fhir_capacidades()

Capacidades del servidor

fhir_peticion()

Hacer una petición FHIR cualquiera

fhir_ejecutar_texto()

Ejecutar una petición escrita como texto

fhir_vista()

Ejecutar una vista contra un servidor FHIR

fhir_disponible()

Comprobar si un servidor FHIR responde

Autenticación SMART on FHIR

OAuth2 para servidores protegidos: client credentials, SMART Backend Services (JWT firmado) e inicio de sesión en el navegador con PKCE.

fhir_auth_cliente() fhir_auth_backend() fhir_auth_interactiva()

Autenticación SMART on FHIR (OAuth2)

fhir_smart_configuracion()

Descubrir la configuración SMART de un servidor

RStudio

Panel Connections, conexión activa y addins.

fhir_conexion_activa() fhir_desconectar()

Conexión activa y panel Connections de RStudio

addin_peticion() addin_vista()

Addins de RStudio

Recursos FHIR

fhir_recursos()

Reunir recursos FHIR en una lista

fhir_tabla()

Tabla rápida de recursos FHIR

Vistas SQL on FHIR

Convertir recursos FHIR en tablas con un ViewDefinition.

vista_ejecutar()

Ejecutar un ViewDefinition

vista_crear()

Crear un ViewDefinition sencillo

vista_leer()

Leer un ViewDefinition

vista_validar()

Validar un ViewDefinition

vista_json()

Convertir un ViewDefinition en JSON

vista_duckdb()

Guardar vistas en DuckDB

Catálogo de vistas

ViewDefinition listos para vigilancia y salud pública.

vista_catalogo()

Catálogo de vistas listas para usar

vista_plantilla()

Obtener una vista del catálogo

Motor DuckDB (experimental)

Traducir vistas a SQL y ejecutarlas sobre NDJSON o Parquet sin cargar los recursos en R.

vista_ejecutar_duckdb()

Ejecutar un ViewDefinition con DuckDB (experimental)

vista_sql()

Traducir un ViewDefinition a SQL de DuckDB (experimental)

Terminologías

Expandir ValueSets, buscar y validar códigos en un servidor de terminología, y usar las expansiones en las vistas.

tx_expandir()

Expandir un ValueSet en un servidor de terminología ($expand)

tx_buscar_codigo()

Buscar un código en un sistema de codificación ($lookup)

tx_validar_codigo()

Validar códigos contra un ValueSet ($validate-code)

vista_con_valueset()

Filtrar una vista con los códigos de un ValueSet

Conformidad

vista_conformidad()

Banco oficial de pruebas de SQL on FHIR

FHIRPath

vista_fhirpath()

Evaluar una expresión FHIRPath

fhirviews_motor() fhirviews_version_fhirpath()

Motor de FHIRPath y versión de fhirpath.js

Paquete

fhirviews fhirviews-package

fhirviews: FHIR desde R y vistas tabulares con SQL on FHIR